El crecimiento constituye uno de los rasgos de mayor relevancia económica en acuicultura y continúa siendo un foco central de los programas de mejoramiento genético en salmón Atlántico (Salmo salar ). En este estudio se realizaron análisis de asociación a genoma completo (GWAS) para tres rasgos clave relacionados con el crecimiento: Tasa Específica de Crecimiento (SGR), Coeficiente de Crecimiento Térmico (TGC) y Equivalente de Pescado Entero (WFE). Los datos fenotípicos provinieron de 1302 individuos pertenecientes a 200 familias de hermanos completos del Programa de Mejoramiento Genético de la empresa Salmones Camanchaca. Todos los individuos fueron genotipificados mediante un microarreglo personalizado de 62K SNPs para salmón Atlántico.
Las estimaciones de heredabilidad fueron moderadas para todos los rasgos (h²SGR = 0,29; h²TGC = 0,29; h²WFE = 0,33), y se observaron fuertes correlaciones genéticas entre ellos (entre 0,49 y 0,91). Con base en 46 998 SNPs de alta calidad retenidos tras el control de calidad, ningún SNP superó el umbral de significancia a nivel genómico. Sin embargo, tres SNPs alcanzaron significancia a nivel cromosómico: uno asociado a SGR en el cromosoma 22 (Ssa22) y dos asociados a WFE en el cromosoma 17 (Ssa17). No se detectaron asociaciones significativas para TGC.
En las proximidades de estos loci se identificaron trece genes candidatos, principalmente relacionados con la organización del citoesqueleto ( arpc2, caldl, krt18l, ifon3l), la contracción muscular (tnntl , tnni1, tnnt2b, spegl , mybphl), las vías de señalización (igfbp5, igfbp2) y la adhesión focal (tns ). Nuestros resultados sugieren una arquitectura poligénica subyacente al crecimiento en salmón Atlántico, caracterizada por numerosos loci de pequeño efecto. La heredabilidad moderada a alta y la variabilidad genética observada respaldan la factibilidad de incorporar estos rasgos en programas de selección genómica, con el fin de mejorar la precisión en los cálculos de méritos genéticos.
Financiamiento: Beca ANID Doctorado Nacional – Folio 21250925
Palabras clave: GWAS, salmón, crecimiento, SNPs, Chile