La trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss ) es una especie clave en la acuicultura chilena, afectada por importantes desafíos sanitarios como la septicemia rickettsial salmonídea (SRS), causada por Piscirickettsia salmonis. En programas de mejoramiento genético se ha documentado una correlación genética negativa entre resistencia a SRS y crecimiento, lo que sugiere la presencia de mecanismos pleiotrópicos que limitan la mejora simultánea de ambos rasgos.
En este estudio se evaluaron 2.130 individuos pertenecientes a un núcleo de mejoramiento genético, distribuidos en 105 familias y desafiados experimentalmente con la cepa LF-89 de P. salmonis. Se registraron tres fenotipos: tiempo de muerte (TD), supervivencia binaria (BS) y peso final (EW). Los peces fueron genotipados mediante un chip de 57K SNPs y posteriormente se imputaron datos de secuenciación completa obtenidos de 102 individuos.
Se realizaron estudios de asociación genómica (GWAS) para cada rasgo, estimaciones de correlaciones genéticas globales y análisis de correlaciones genéticas locales (CGL) a partir de bloques definidos por patrones de desequilibrio de ligamiento. Las CGL permitieron identificar regiones con señales pleiotrópicas significativas, algunas asociadas a relaciones favorables entre peso final y resistencia, y otras que evidencian compromisos genéticos. El análisis funcional de genes presentes en estas regiones reveló procesos biológicos clave, incluyendo metabolismo energético, transporte transmembrana, ensamblaje de cilios, regulación inmune y reparación de ADN.
Estos resultados aportan nuevas evidencias sobre la base genética compartida entre peso final y resistencia a SRS en trucha arcoíris, y ofrecen candidatos genéticos relevantes para optimizar programas de selección que integren simultáneamente rasgos productivos y sanitarios.