Latin American & Caribbean Aquaculture 2019

November 19 - 22, 2019

San Jose, Costa Rica

IDENTIFICACION DE DOS CANDIDATOS A VACUNAS CONTRA Caligus rogercresseyi: UNA APROXIMACION BASADA EN VACCINOLOGIA REVERSA

Antonio Casuso*1, 2 , Cristian Gallardo-Escárate
 
1 Laboratory of Biotechnology and Aquatic Genomics , Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR), Universidad de Concepción, P.O. Box160-C, Concepción, Chile.
2Doctorate Program in Management of Aquatic Living Resources, Universidad de Concepción, Concepción, Chile.
 

El uso de vacunas  en  la acuicultura de salmones en Chile permite controlar el brote de varias enfermedades virales y bacterianas.  Sin embargo, no se ha logrado establecer vacunas efectivas contra enfermedades parasitarias.  El copépodo marino  Caligus rogercresseyi  es un ectoparásito conocido como piojos de mar. Esta especie es una de los principales patógenos que afecta el cultivo de salmón Atlántico . El desarrollo de estrategias de control basadas en vacunas para el control de piojos de mar no ha sido posible con los métodos  clásicos para la identificación de antígenos candidatos.  El objetivo de este estudio fue  utilizar bases de datos transcriptómicas para identificar in silico candidatos potenciales a vacuna s para el control de C. rogercresseyi .

Los análisis se realizaron a partir de bases de datos transcriptómicas de las en diferentes etapas de desarrollo de C. rogercresseyi ,  obtenidas mediante secuenciación Illumina.  Los contigs se compararon con la base de datos de proteínas de crustáceos y/o artrópodos que se elaboraron utilizando NCBI y UniProt . Se determinó el ORF de las secuencias identificadas y traducidas a secuencias proteicas. Seguidamente s e realizaron análisis  múltiple de secuencias con  otras proteínas conocidas.  Los niveles de expresión de los candidatos se evaluaron mediante RNA-Seq y  se validaron por RT-qPCR . Las pruebas de predicción in silico de epítopos T y B lineales fueron realizadas por el software BepiPred y TEPITOPE, respectivamente.

Como resultados, se identificaron dife rentes isoformas de peritrofina con diferencias en el número de dominios de unión a quitina, y una isoforma de DMT1 . Las dos proteínas mostraron patrones de expresión diferencial  entre las etapas de desarrollo del piojo de mar.  Además, se identificaron epítopos lineales de linfocitos B y T tanto en peritrofinas como en DMT1 . Estos resultados demuestran el  potencial antigénico de las  proteínas identificadas en C. rogercresseyi . En posterio res investigaciones,  a través de pruebas in vivo en salmones cultivados, se  demostrarán la acción inmunogénica de las peritrofinas y DMT1 contra el piojo de mar.

Agradecimientos: Este estudio fue financiado por  FONDAP #15110027 y CONICYT-PCHA/Doctorado Nacional (Beca 2018-21180084).

e -mail address: acasuso@udec.cl